陈安进,石杰

• 1:中国海洋大学
• 2:中国海洋大学 山东青岛266003
• 3:青岛市市立医院
• 4:山东青岛266011

摘要(Abstract)：

通过检索国内外相关领域的大量研究文献,并结合作者的研究经验,综述了计算机辅助药物设计中计算方法的发展及其应用的最新进展,并对计算方法的选用原则进行了探讨,以期为从事CADD工作者合理选择建模计算方法提供有价值的参考。

关键词(KeyWords)： 计算机辅助药物设计(CADD);定量构效关系(QSAR);计算方法

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation):

作者(Author): 陈安进,石杰

DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.2005.03.011

参考文献(References)：

• [1]　MartinYC .QuantitativeDrugDesign[M ].NewYork:MarcelDekker,1978.
• [2]　杨　蕾,王　鹏,周德瑞,等.新型氯喹酸酯类除草剂的定量构效关系分析[J].清华大学学报(自然科学版),2004,44(3):323325.
• [3]　SwetsD ,WengJ.Usingdiscriminanteigenfeaturesforimagere trieval[J].IEEETransactionsonPatternAnalysisandMachineIn telligence,1996,18(8):831836.
• [4]　YuH ,YangJ.AdirectLDAalgorithmforhighdimensionaldatawithapplicationtofacerecognition[J].JournalofPatternRecogni tion,2001,34(10):20672070.
• [5]　ChenL ,LiaoH ,KoM ,etal.AnewLDA basedfacerecognitionsystemwhichcansolvethesmallsamplessizeproblem[J].JournalofPatternRecogintion,2000,33(10):17131726.
• [6]　何　梅,李通化,丛培盛.用数值遗传算法改进非线性PLS法进行构效关系研究[J].高等学校化学学报,1997,18(6):854859.
• [7]　颜学峰,陈德钊,胡上序.用自适应偏最小二乘回归为药物定量构效关系建模[J].分析化学,2002,30(5):536539.
• [8]　张崇甫,陈述云.成分数据主成分分析及其应用[J].数理统计与管理,1996,15(3):1114.
• [9]　WoldS ,SiostromM .Chemometrics,TheoryandApplication[M].Washington,DC :AmericanChemicalSociety,1977.
• [10]　MiyashitaY ,TakahashiY ,SasakiS,etal.Structure tastsecorre lationofL AspartyldipeptidesusingSIMCAmethod[J].JMedChem,1986,(29):906912.
• [11]　陈　曦,王丽君,胡上序,等.优化星座聚类法和有机氟农药构效关系识别[J].数值计算与计算机应用,1997,(2):135142.
• [12]　McFarlandW ,GansJ.Clustersignificanceanalysiscontrastedwiththreeotherquantitativestructure activityrelationshipmethods[J].JMedChem,1987,(30):4649.
• [13]　侯廷军,徐筱杰.遗传算法在计算机辅助药物分子设计中的应用[J].化学进展,2004,16(1):3541.
• [14]　TetkoJV ,LuikAI,PodaGI .Applicationsofneuralnetworksinstructure activityrelationshipsofasmallmumberofmolecules[J].JMedChem,1993,36(7):811.
• [15]　CambonB ,DevillersJ.Newtrendsinstructure biodegradabilityre lationships[J].QuantStructActRelat,1993,(12):49.
• [16]　WesselMD ,JursPC .Predictionofreducedionofreducedionmo bilityconstantsfromstructuralinformationusingmultiplelinearre gressionanalysisandcomputationalneuralnetworks[J].AnalChem,1994,66(15):24802487.
• [17]　GakhA ,GakhE ,SumpterBG .Neuralnetwork=graphtheoryap proachtothepredictionofthephysicalpropertiesoforganiccom pouds[J].JChemInfComputSci,1994,34(4):832839.
• [18]　BrasquetC ,CloirecP .QSARfororganicsadsorptionontoactivatedcarboninwater:whatabouttheuseofneuralnetworks?[J].WatRes,1999,17(33):36033608.
• [19]　高守国,屈凌波,相秉仁.模糊人工神经网络方法在QSAR研究中的应用[J].计算机与应用化学,2002,19(4):432434.
• [20]　刘　平,程翼宇.辨识药物定量构效关系的模糊神经网络方法研究[J].高等学校化学学报,2000,2(10):14731478.
• [21]　李永武,叶志前,陆金芳.化合物构效关系的模糊极小极大神经网络识别研究[J].生物医学工程学杂志,2002,19(3):449451.
• [22]　张晓晨,周家驹.改进的人工神经网络算法(Ⅰ)———网络结构的优化和收敛判据[J].计算机与应用化学,1995,12(3):186191.
• [23]　BorgesE ,TankahataY .QSARstudyofanti ulcercompoundsusingcalculatedparameters[J].JournalofMolecularStructure,2001,(539):24525.

文章评论(Comment)：